194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0565 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 673 aa  1390    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 600 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 571 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 584 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 584 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  30.82 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 629 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 564 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 615 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 555 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 594 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 638 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 568 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 615 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 557 aa  137  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 593 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 587 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 568 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 623 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 646 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 568 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 579 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 625 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 583 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 531 aa  97.8  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 677 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 581 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 557 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 540 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 595 aa  89  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  29.89 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  33.87 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 613 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.02 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 601 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 582 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.05 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 497 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 611 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  34.16 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  27.56 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  22.03 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 520 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.72 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  21.21 
 
 		 560 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 499 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  21.07 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 521 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 521 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.05 
 
 		 507 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  35.54 
 
 		 514 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>