222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1844 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 601 aa  1248    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 636 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 615 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 600 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  23.72 
 
 		 594 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 599 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 549 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 595 aa  99.4  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  23.14 
 
 		 629 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 626 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 583 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 561 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 568 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 566 aa  90.1  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 623 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 614 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 642 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.15 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 587 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 607 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 592 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  22.31 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  31.03 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.7 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  32.95 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 505 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 587 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  31.72 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  32.89 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  22.44 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  22 
 
 		 592 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  35.44 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  28 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>