254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1801 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 587 aa  1202    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  41.34 
 
 		 582 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  36.61 
 
 		 627 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 571 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  29.35 
 
 		 666 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 568 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 564 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 565 aa  190  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  34 
 
 		 559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  32.92 
 
 		 583 aa  163  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 561 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 529 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 600 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 623 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 615 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  33.67 
 
 		 555 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 617 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 630 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 587 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 615 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 540 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 581 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 639 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 629 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 568 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 633 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 579 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 625 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 511 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 629 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 522 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 631 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 506 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 614 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 473 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 642 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 512 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 507 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 540 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 514 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.66 
 
 		 487 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 638 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 590 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 508 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 589 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.39 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 596 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 677 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 481 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.05 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>