277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1343 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 631 aa  1303    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  33.18 
 
 		 607 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 636 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 633 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 639 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 615 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 615 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 568 aa  130  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 593 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 584 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 587 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 600 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 576 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 588 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 568 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 582 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 565 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 590 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 626 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 606 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 549 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 579 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 576 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 559 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.28 
 
 		 666 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 587 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 557 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 584 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 583 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 529 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 550 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 625 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 582 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 629 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 531 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 620 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 627 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 638 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 629 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  46.46 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 601 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 595 aa  73.6  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  27.51 
 
 		 577 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  21.72 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  21.92 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2110  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.34 
 
 		 502 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  37.4 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  22.3 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 541 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  42.86 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>