137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4125 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 602 aa  1237    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  45.37 
 
 		 612 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  30.94 
 
 		 577 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 611 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 590 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 540 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 550 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 531 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 519 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  22.58 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 548 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 499 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 502 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  22 
 
 		 582 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 508 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 622 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  23.51 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.92 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  21.44 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.62 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.27 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  22.68 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 514 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  21.1 
 
 		 588 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 627 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 448 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 583 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 478 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 470 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 561 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 582 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 522 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 559 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.85 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.45 
 
 		 499 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 480 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.14 
 
 		 664 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 462 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 612 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 519 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.13 
 
 		 494 aa  50.8  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  28.34 
 
 		 667 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  22.03 
 
 		 594 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>