265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2061 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 528 aa  1089    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  40.55 
 
 		 524 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  33.67 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 492 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 476 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 477 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 514 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 501 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 664 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.26 
 
 		 499 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.14 
 
 		 494 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 511 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 488 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 530 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.36 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  22.85 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 505 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.69 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.63 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  22.6 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  22.69 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  21.54 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 591 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  23.97 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 530 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.9 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  21.97 
 
 		 531 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 565 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>