205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3257 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 522 aa  1075    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  36.08 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 490 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  34.38 
 
 		 524 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  34.31 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  32.37 
 
 		 492 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 491 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 476 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  27.33 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 491 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 514 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.55 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.15 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 591 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.56 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  22.71 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  32.31 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.19 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  24.38 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 473 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 527 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  39.23 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  22.56 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 510 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 522 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  24.66 
 
 		 504 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  30.18 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.41 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  24.01 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 604 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.49 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  21.5 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 479 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  39.23 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  34.19 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  35.61 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  22.46 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  35.88 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>