284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6167 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 530 aa  1094    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  51.31 
 
 		 530 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  47.81 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  43.71 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  40.65 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 564 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  28.49 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  26.05 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 539 aa  136  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 538 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 537 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 487 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 541 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.82 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.77 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 494 aa  110  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.53 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 502 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 540 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 508 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 548 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 481 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 533 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  23.96 
 
 		 490 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 492 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 477 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 562 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  33.04 
 
 		 537 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 556 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 479 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 539 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 527 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  24.01 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.51 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  26.45 
 
 		 557 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 486 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 507 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 521 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26 
 
 		 461 aa  90.1  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 582 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 506 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 477 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 544 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  22.81 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>