More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6635 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 483 aa  992    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  45.64 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  38.42 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 500 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  32.72 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  31.01 
 
 		 461 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  32.72 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 448 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  30.79 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  31.77 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.04 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.91 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 482 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  29.78 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.18 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.16 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 498 aa  106  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  28.27 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 521 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.45 
 
 		 532 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 477 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  28.72 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 534 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 473 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.5 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 478 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  29.3 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 540 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 502 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 480 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.91 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.89 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 504 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 503 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.3 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.75 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 493 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.25 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  26.27 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  26.85 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  23.64 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.1 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>