284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4374 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  966    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  51.27 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  49.89 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  40.22 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  37.3 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  39.1 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  35.47 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  39.47 
 
 		 479 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  37.32 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  36.93 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  36.83 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  35.1 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  35.32 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  35.6 
 
 		 480 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  35.17 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  35.16 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  35.79 
 
 		 462 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  34.42 
 
 		 453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  33.48 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 457 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  30.18 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.64 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 502 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.99 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.97 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 494 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.65 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 499 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 508 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.43 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 531 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  22.24 
 
 		 488 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.14 
 
 		 498 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 613 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 531 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  23.73 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  27.31 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.74 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>