129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1992 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  928    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  41.02 
 
 		 449 aa  292  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  39.78 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  37.89 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  39.22 
 
 		 459 aa  262  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  34.79 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  37.88 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  35.45 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  31.96 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 456 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  29.59 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  29.57 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  29.62 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.3 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.52 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  27.62 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 475 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  29.84 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  24.11 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 484 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  26.26 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.73 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.46 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  26.54 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  26.27 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  23.9 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  23.14 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.57 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  22.92 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  23.17 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.49 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  32.26 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.04 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.4 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 466 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 481 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 499 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  33.06 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  23.98 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 527 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  24.92 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 519 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  23.14 
 
 		 492 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  38.89 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  24.4 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6807  hypothetical protein  30.77 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  hitchhiker  0.0000033476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>