66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1073 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1030    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  41.48 
 
 		 492 aa  350  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  37.42 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  40.12 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  39.11 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  36.24 
 
 		 496 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  38.65 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.08 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  29.02 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 475 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  26.65 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  25.54 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.48 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  23.24 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.67 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  23.9 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  23.91 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  23.9 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.15 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  26 
 
 		 450 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  24.8 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  23.34 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  22.37 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  27.27 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 456 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  22.59 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  23.42 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  23.81 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 574 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 456 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  30.41 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  30.61 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5146  hypothetical protein  26.11 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000128117  hitchhiker  0.00789925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  22.52 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  21.86 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 556 aa  47  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  26.36 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  22.28 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 491 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 664 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  22.17 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>