118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5146 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5146  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1036    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000128117  hitchhiker  0.00789925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  28.9 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  30.84 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  24.05 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  29.44 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  22.32 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.82 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  22.26 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  21.57 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.7 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  22.59 
 
 		 574 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.68 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 629 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 620 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 456 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 491 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 612 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 549 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 622 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 599 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  26.11 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  22.66 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 594 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 600 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 638 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  22.45 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 491 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  22.09 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 506 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 452 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 481 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 650 aa  47  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.35 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  25.68 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  21.7 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  24.81 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  26.47 
 
 		 604 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.8 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  21.75 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2110  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>