More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2098 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 464 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  39.32 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  38.43 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  33.47 
 
 		 479 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  36.19 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  35.64 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  32.83 
 
 		 464 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  35.22 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  31.72 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  32.72 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  34.97 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  33.4 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  31.85 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  31.79 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  29.34 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  31.34 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  31.04 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 466 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.36 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.44 
 
 		 494 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 481 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 447 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 491 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  26.79 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.87 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 497 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 503 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 508 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 502 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.86 
 
 		 490 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 514 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.72 
 
 		 487 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 542 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 491 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.06 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 498 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 498 aa  93.2  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 483 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.16 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 549 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 507 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 501 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 503 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 511 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  24.31 
 
 		 451 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.28 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 504 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>