More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4209 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 456 aa  920    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  46.94 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  32.85 
 
 		 461 aa  179  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  32.78 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  33.86 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  33.05 
 
 		 483 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  32.07 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.27 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  27.85 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 502 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  31.25 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  32.41 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.98 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 504 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 488 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.81 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 497 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.57 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 500 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 484 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.63 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.97 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.44 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 488 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  31.28 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 508 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 503 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  27 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.12 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  26.94 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.1 
 
 		 511 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  31.59 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.15 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 499 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>