287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1361 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 426 aa  872    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.98 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 483 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.27 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 501 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 499 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.32 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  29.92 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.25 
 
 		 494 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 477 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 479 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  26.83 
 
 		 446 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  29.86 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 511 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.33 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 521 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 500 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 506 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 514 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 491 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 480 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 498 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 502 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 466 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 478 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 487 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 522 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  29.89 
 
 		 467 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 496 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 462 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 512 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 479 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.36 
 
 		 490 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.99 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>