215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0726 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 448 aa  926    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2110  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 476 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 448 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.34 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.8 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 486 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 493 aa  90.1  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 479 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.43 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.15 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.07 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.2 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.09 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.42 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  26.32 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.1 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.14 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.9 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.26 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  25.79 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  22.82 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  23.11 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>