165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0906 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  958    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  41.05 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  38.96 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  40.09 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  37.02 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  33.7 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  35.45 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  33.12 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  29.54 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  29.55 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  27.97 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  28.3 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  26.51 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  25.73 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  26.18 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  27.51 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  27.76 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.09 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  35.85 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.55 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.25 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.34 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  25.34 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  23.02 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  24.33 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  24.42 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  21.57 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  22.69 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>