211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0057 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 487 aa  1004    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  42.48 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  30.48 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  28.38 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  28.54 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  27.07 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.16 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.52 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  25.91 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  27.63 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  29.17 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  27.57 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.34 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.44 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  26.72 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  26.91 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  26.46 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  24.51 
 
 		 440 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  27.32 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.7 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  25.27 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.69 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  22.55 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  24.3 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  22.66 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  27.23 
 
 		 519 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 502 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  22.01 
 
 		 457 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.52 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.22 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  38.96 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.87 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.8 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  23.4 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  43.42 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  38.67 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  34.17 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  26.17 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  23.15 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  37.33 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  37.33 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  40.26 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  39.02 
 
 		 574 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>