248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3049 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 475 aa  984    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  28.96 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  27.61 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  26.11 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  27.52 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.1 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  26.89 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  27.08 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  25.36 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  28.21 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  28.1 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.29 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  27.98 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  26.68 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 493 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 452 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  26.24 
 
 		 452 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 478 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  25.15 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.74 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  28.46 
 
 		 461 aa  95.1  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  24.08 
 
 		 497 aa  93.6  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 497 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  28.65 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  24.95 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  25.89 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.17 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.35 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  26.86 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  28.87 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  24.19 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  24.24 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.51 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  25.66 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  24.15 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  22.97 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>