109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1735 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  998    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  63.16 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  54.53 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  54.53 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  49.28 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  38.65 
 
 		 497 aa  306  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  37.34 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  26.44 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.35 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 475 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 440 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  28.06 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  25.34 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  29.36 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  25.45 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  23.68 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  25.1 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.1 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  22.64 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.9 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  41.75 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.51 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 484 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 499 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  26.87 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  24.85 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  25.56 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.63 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  29.66 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.11 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  22.29 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  34.33 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  22.33 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  23.03 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  22.13 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 531 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 577 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 612 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  25.6 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 527 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  22.82 
 
 		 490 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.35 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  23.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.22 
 
 		 532 aa  46.6  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 453 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 613 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  22.15 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>