266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0974 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 462 aa  956    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  44.8 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  30.04 
 
 		 492 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  28.37 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 500 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.11 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.69 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.75 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 477 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.26 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.42 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.15 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  23.6 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 577 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.77 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  23.85 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  23.91 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  22.92 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  26.53 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  24.79 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.71 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  24.15 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.13 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  24.36 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  25.17 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  22.99 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  24.53 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>