More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0680 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 477 aa  987    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  44.12 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  42.09 
 
 		 483 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  40.77 
 
 		 479 aa  332  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  39.09 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  36.69 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  36.81 
 
 		 498 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  38.02 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  37.55 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  35.26 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  37.23 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  35.94 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  35.6 
 
 		 486 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  35.03 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  34.9 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.66 
 
 		 502 aa  242  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  37.5 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  36.03 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  34.83 
 
 		 494 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  35.88 
 
 		 519 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  34.37 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  35.65 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  35.01 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  35.08 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.68 
 
 		 490 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  32.1 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  32.4 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  34.14 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 511 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  34.3 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.9 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 493 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.74 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.35 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 541 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.77 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.78 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 534 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  34.24 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 506 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  30.4 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 487 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 531 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 503 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 511 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  29.81 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.6 
 
 		 532 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.41 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 472 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 504 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 456 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.97 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  31.02 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.22 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 533 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 540 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>