More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5114 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 480 aa  986    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  45.61 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  41.54 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  44.42 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  43.5 
 
 		 493 aa  358  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  39.4 
 
 		 472 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  42.09 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  42.43 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  42.35 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  42.4 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  40.94 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  42.42 
 
 		 480 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  41.67 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  39.33 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  38.41 
 
 		 494 aa  302  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  38.52 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  37.69 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  36.83 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  38.83 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  38.24 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  37.04 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  36.48 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  34.97 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  36.31 
 
 		 466 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  32.56 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 448 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 457 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  31.11 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 502 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.99 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.22 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 490 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 501 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.54 
 
 		 490 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.16 
 
 		 499 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.1 
 
 		 507 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 508 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  32.46 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 507 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.44 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 664 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  26.58 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.47 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>