184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2265 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  916    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  43.2 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  39.82 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  40.67 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  40.09 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  40.32 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  39.78 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  37.98 
 
 		 454 aa  273  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  32.62 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  33.04 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  29.72 
 
 		 451 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  31.34 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  31.32 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  26.71 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.93 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  27.39 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  29.3 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  26.08 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 484 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  26.01 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  27.1 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 478 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 486 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.94 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  25.49 
 
 		 484 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.43 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 504 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  24.85 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.5 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  27.02 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.93 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.7 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  22.24 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 480 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  25.52 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  27.39 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  25.06 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  22.83 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>