More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3988 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 478 aa  989    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  49.67 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  47.56 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  41.15 
 
 		 510 aa  362  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  41.04 
 
 		 456 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  41.55 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  38.05 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  38.4 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  40.04 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  39.18 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  36.48 
 
 		 471 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  37.37 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  37.42 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  36.02 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  36.11 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  41.63 
 
 		 480 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  35.43 
 
 		 494 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  36.83 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  37.34 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  36.32 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  36.04 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  35.82 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  34.42 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  33.26 
 
 		 464 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  31.24 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 479 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.07 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.76 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 496 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  32.01 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.15 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.93 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  26.96 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.08 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 527 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 495 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 540 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.58 
 
 		 511 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 499 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.5 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 491 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  26.62 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 522 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  26.58 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 519 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 507 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 622 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>