225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0268 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 502 aa  1035    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  47.51 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  28.36 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.28 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 482 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 484 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.91 
 
 		 458 aa  94.4  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 504 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 500 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 456 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 426 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  25.43 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 488 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.71 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.24 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 487 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  27.58 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.3 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  23.61 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.48 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.44 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.88 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  29.36 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.19 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  25.79 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  21.8 
 
 		 571 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 531 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  27.8 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  24.89 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  30.59 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  24.6 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>