90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2192 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1001    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  63.16 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  58.74 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  55.53 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  50.64 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  39.11 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  37.01 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.61 
 
 		 459 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 475 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  23.21 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  27.31 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  23 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  24.11 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  24.22 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  25.69 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  26.8 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.49 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  23.99 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  23.65 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.54 
 
 		 449 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  22.62 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  24.72 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  34.12 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.07 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  23.46 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  21.74 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  23.4 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  22.01 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  24.06 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 664 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  21.64 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  26.23 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  23.41 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 494 aa  50.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 497 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  21.71 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  21.44 
 
 		 494 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  21.89 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  22.3 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.19 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  23.17 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  25.82 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 478 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>