296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1925 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1059    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.11 
 
 		 490 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  30.79 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.98 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 504 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 476 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 447 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.32 
 
 		 461 aa  98.6  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.1 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 487 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 486 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 507 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 493 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  24.1 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.53 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 495 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 472 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.26 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  22.46 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.34 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  27.22 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  25.85 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  37.58 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  21.99 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  22.18 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.22 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  23.68 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.51 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  28.03 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.65 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  29.09 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.11 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>