More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0956 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 498 aa  1020    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  68.59 
 
 		 501 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  40.87 
 
 		 483 aa  319  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  42.07 
 
 		 479 aa  309  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 500 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  38.67 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  36.84 
 
 		 477 aa  282  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  37.57 
 
 		 481 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  38.49 
 
 		 519 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  40.51 
 
 		 514 aa  263  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  36.69 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  39.58 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  39.14 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  34.78 
 
 		 478 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  35.13 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  35.81 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  36.56 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  34.17 
 
 		 486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.62 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  34.79 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.17 
 
 		 477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 499 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  34.53 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  34.12 
 
 		 487 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  32.83 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  33.02 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 493 aa  183  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  34.36 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  33.85 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 503 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.51 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  33.71 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.36 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 508 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  34.56 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  29.68 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.36 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.81 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.58 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 527 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 506 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.77 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.7 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 462 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 511 aa  136  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.52 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 548 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 496 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 582 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 549 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 456 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 534 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 520 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 601 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 503 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  33.44 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>