More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0518 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 483 aa  993    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  57.36 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  38.73 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  34.52 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 497 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  33.4 
 
 		 491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.19 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  34.12 
 
 		 473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32.4 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.6 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 476 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  32.32 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.59 
 
 		 519 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  35.28 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  32.91 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 514 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.68 
 
 		 499 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.69 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.88 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 506 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 522 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 513 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.24 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.35 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  28.52 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 507 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 492 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.99 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.84 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 549 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 540 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 503 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 505 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 480 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 557 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.82 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.64 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>