More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2992 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 576 aa  1198    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  52.61 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  52 
 
 		 592 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  53.47 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  48.45 
 
 		 598 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  47.64 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  45.05 
 
 		 601 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  47.99 
 
 		 582 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  45.07 
 
 		 588 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  47.32 
 
 		 582 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  47.64 
 
 		 579 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  44.44 
 
 		 592 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  39.3 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  33.45 
 
 		 556 aa  227  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  31.76 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 493 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 494 aa  160  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 506 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.76 
 
 		 507 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 523 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.23 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.89 
 
 		 494 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 476 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 503 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 483 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 497 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 548 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 577 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.36 
 
 		 511 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 448 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.88 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.66 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.55 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.27 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 548 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 511 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 480 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 481 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 503 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 561 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 584 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 447 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>