290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3283 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 579 aa  1200    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  53.64 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  49.25 
 
 		 594 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  45.81 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  45.44 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  42.69 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  42.51 
 
 		 601 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  42.69 
 
 		 592 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  41.81 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  42.74 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  38.99 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  42.02 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  34.26 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.32 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.07 
 
 		 507 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.57 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 506 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.68 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 531 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 498 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.13 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 501 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 498 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.25 
 
 		 511 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 639 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 494 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.34 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 557 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 600 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 599 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 571 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 506 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 476 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 529 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.14 
 
 		 461 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 448 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 486 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 574 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 483 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 548 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 513 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 568 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 548 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 519 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  35.59 
 
 		 531 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 577 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 488 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  33 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  22.75 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>