More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6054 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 499 aa  1031    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  50.2 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  50.93 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  43.95 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  42.17 
 
 		 508 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  39.25 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  39.09 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.85 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  36.11 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  36.13 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  35.33 
 
 		 476 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 494 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  35.39 
 
 		 479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  35.98 
 
 		 541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  34.82 
 
 		 481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 522 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  33.66 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 493 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  32.77 
 
 		 499 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  33.86 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  34.46 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.94 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  32.27 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  34.82 
 
 		 478 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  34.88 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.89 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  33.89 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  32.88 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 497 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  33.54 
 
 		 473 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  33.47 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.85 
 
 		 502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 594 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  33.41 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 513 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  29.85 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  35.05 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 		 570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.08 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  32.64 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 582 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 601 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.61 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.59 
 
 		 476 aa  170  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  31.19 
 
 		 511 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 579 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 582 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  29.13 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 531 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 514 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 534 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 592 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 503 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 598 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 592 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  29.62 
 
 		 507 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.69 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  39.36 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 519 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>