More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3391 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 507 aa  1046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  42.88 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  36.98 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  35.6 
 
 		 483 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  36.66 
 
 		 476 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  34.84 
 
 		 523 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  34.58 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.88 
 
 		 481 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  34.68 
 
 		 494 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  35.19 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  33.46 
 
 		 522 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 473 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  34.83 
 
 		 499 aa  193  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.06 
 
 		 490 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  30.48 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  32.51 
 
 		 498 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 494 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  32.22 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  33.66 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  32.28 
 
 		 511 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.74 
 
 		 514 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 531 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 497 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 500 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 549 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 499 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 579 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 522 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 582 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  33.11 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 506 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 540 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  32.44 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 497 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 487 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  31.13 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 588 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 582 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 549 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 592 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 592 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 527 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 579 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.02 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 612 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 533 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 548 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  30.52 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 664 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>