More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3595 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 527 aa  1096    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  44.61 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  47.62 
 
 		 603 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  41.13 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  44.57 
 
 		 664 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  42.33 
 
 		 613 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  42.5 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  40.7 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  39.77 
 
 		 626 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 572 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 622 aa  203  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 591 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 506 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 479 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 478 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.6 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 531 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 491 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 495 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 502 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.47 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 501 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.31 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 534 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 479 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.51 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 601 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 491 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.73 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 499 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.89 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.57 
 
 		 498 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 489 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 592 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 473 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 556 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 512 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.71 
 
 		 476 aa  123  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.18 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 541 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.96 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 549 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>