292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0554 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 582 aa  1194    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  43.64 
 
 		 614 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 531 aa  170  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 527 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 477 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 548 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 502 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 507 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 498 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 593 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 549 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 481 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 550 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.27 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 594 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 565 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 511 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 564 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 584 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 568 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 615 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.85 
 
 		 494 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 599 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 489 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 557 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.54 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 582 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 587 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 460 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 521 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 540 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 631 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 503 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 493 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  32.06 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 623 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.97 
 
 		 476 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 470 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 494 aa  93.6  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  23.67 
 
 		 487 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 664 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  23.14 
 
 		 576 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 582 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 617 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 491 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.44 
 
 		 666 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>