283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3644 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 615 aa  1286    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  50 
 
 		 615 aa  614  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  48.14 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  51.58 
 
 		 626 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  51.47 
 
 		 625 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 561 aa  273  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  34.21 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 600 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  31.27 
 
 		 568 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 593 aa  204  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 557 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 571 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 559 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 568 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 531 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 529 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 579 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 631 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 630 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 584 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 639 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 642 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 673 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 582 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 582 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 557 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 638 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 511 aa  138  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 666 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 633 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 607 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 540 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 587 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 620 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 601 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 579 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 595 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 528 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 582 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 576 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 611 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.75 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 477 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 617 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 541 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 460 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 476 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  22.03 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 511 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 664 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  22.65 
 
 		 540 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  22.32 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.05 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  22.41 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  37.14 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  22.54 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>