261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0197 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 595 aa  1234    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 531 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 531 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 527 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 594 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 611 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 626 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 615 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 549 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 615 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 564 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 623 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 568 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 548 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 636 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 559 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 568 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 593 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 557 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 584 aa  87  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 673 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 625 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  32.12 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  23.42 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  22.11 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.46 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  23.52 
 
 		 666 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  20.64 
 
 		 574 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 620 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  34.53 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  21.72 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  34.51 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.55 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  34.46 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 462 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.19 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  32.03 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  21.95 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  32.86 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  35.33 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.56 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  33.54 
 
 		 527 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  34.51 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 538 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  32.43 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  34.53 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 576 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>