179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4978 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  86.81 
 
 		 576 aa  1056    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 576 aa  1189    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  48.21 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  41.04 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  42.06 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  40.47 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  36.09 
 
 		 606 aa  319  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 611 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  32.45 
 
 		 550 aa  213  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  31.96 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 612 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 602 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 531 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 650 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 557 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 549 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 631 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 630 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 527 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 505 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 568 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 615 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 636 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 568 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 511 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 584 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 579 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.06 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  21.82 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.21 
 
 		 498 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 615 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 593 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  22.46 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  22.29 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  22.69 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 627 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 598 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 512 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  22.29 
 
 		 490 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>