278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4817 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 564 aa  1173    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  50.52 
 
 		 571 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  45.17 
 
 		 584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  40.85 
 
 		 568 aa  339  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  38.57 
 
 		 557 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  37.21 
 
 		 568 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  37.57 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  33.77 
 
 		 600 aa  273  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  34.25 
 
 		 561 aa  263  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 599 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  32.1 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  34.77 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 593 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  34.1 
 
 		 566 aa  226  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 587 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 		 620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 582 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 529 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 540 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.15 
 
 		 505 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 549 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 581 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 615 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 636 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 673 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 625 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 550 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.44 
 
 		 666 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 557 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 638 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 528 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 476 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 576 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 630 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 519 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 588 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 596 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.3 
 
 		 490 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 582 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 508 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 611 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 595 aa  94.4  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.33 
 
 		 499 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  32.76 
 
 		 646 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 503 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 590 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  38.18 
 
 		 494 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 576 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 506 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  39.44 
 
 		 481 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  35.93 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>