253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4636 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  65.83 
 
 		 594 aa  823    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 593 aa  1231    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  40.54 
 
 		 559 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  33.39 
 
 		 568 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 564 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 600 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 568 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 615 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 599 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 561 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 557 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 568 aa  193  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 529 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 565 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 531 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 623 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 583 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 626 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 625 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 511 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 527 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 639 aa  147  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 629 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 636 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 541 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 629 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 581 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 566 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.09 
 
 		 666 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 642 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 582 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 617 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 630 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 607 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 638 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 484 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 497 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 677 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 477 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 627 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 638 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 565 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 611 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  38.18 
 
 		 476 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  39.04 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  40.67 
 
 		 501 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  39.74 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 646 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 506 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 614 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  35.9 
 
 		 498 aa  90.9  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 550 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  40.13 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 595 aa  87.8  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  38.96 
 
 		 498 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 473 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  35.29 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  38.71 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  38.67 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  39.02 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  51.69 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>