More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2301 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 565 aa  1169    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  35.3 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  35.84 
 
 		 533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  33.51 
 
 		 549 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 537 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  32.02 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  33.28 
 
 		 624 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  32.58 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  30.78 
 
 		 573 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 509 aa  156  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 602 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  27.38 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 583 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 542 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 601 aa  130  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  45.24 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 483 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 594 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 539 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 511 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 507 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 610 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.56 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 484 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 639 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.36 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 612 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 593 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 579 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 537 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 503 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 506 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 579 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  23.67 
 
 		 646 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.52 
 
 		 494 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 491 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 592 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 584 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 520 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 601 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 527 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  28.15 
 
 		 750 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 531 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  24.91 
 
 		 667 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 477 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 540 aa  90.1  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.87 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 527 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  28.21 
 
 		 511 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 570 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.66 
 
 		 506 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 542 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 557 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.08 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.4 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>