248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4503 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 607 aa  1269    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  31.89 
 
 		 636 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  33.18 
 
 		 631 aa  256  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 630 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 639 aa  230  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 600 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 571 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 615 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 568 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 623 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 584 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 593 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 587 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 564 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 576 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 587 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 559 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 642 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 629 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 583 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 596 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 629 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 589 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 561 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 614 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 579 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 650 aa  87.8  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 601 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  22.53 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  24.57 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  36.91 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 531 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.98 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 625 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 594 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 626 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  22.64 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  34.88 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  36 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 557 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  21.27 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  33.06 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 599 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  33.11 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.2 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  32.11 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  35.98 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  22.82 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  31.09 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  32.42 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  35.38 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  22.48 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  35.71 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>