260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2473 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  85.23 
 
 		 623 aa  1131    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 615 aa  1279    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  50 
 
 		 615 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  51.11 
 
 		 626 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  50.32 
 
 		 625 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  33.81 
 
 		 561 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 600 aa  196  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 571 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 584 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 583 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 593 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 594 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 587 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 599 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 566 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 529 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 636 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 505 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 630 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 673 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.77 
 
 		 666 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 633 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 607 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 629 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.88 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 579 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 611 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 642 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 581 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 629 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 627 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 595 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 548 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.78 
 
 		 487 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 494 aa  97.4  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  21.73 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.42 
 
 		 489 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.64 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 601 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 589 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.75 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 448 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  20.89 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 520 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 478 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.02 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>