274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2626 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 507 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  36.26 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  34.27 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  33.67 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.04 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 477 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.78 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 480 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 514 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 491 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 549 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 503 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 491 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 502 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 499 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 501 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.24 
 
 		 458 aa  93.6  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  29.7 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 556 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2220  hypothetical protein  25.77 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 555 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 479 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 496 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  25.18 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.69 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 591 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.96 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 519 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.42 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  32.31 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  23.96 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.23 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>