259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1344 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 557 aa  1150    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.26 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 514 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 480 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 499 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 541 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 499 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 476 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 507 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.11 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 491 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 574 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 502 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 529 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.41 
 
 		 490 aa  90.5  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 594 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.36 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 531 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 549 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  25.25 
 
 		 502 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 486 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 477 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.51 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.44 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.32 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 560 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  25.24 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  30.33 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>