257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2261 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 560 aa  1160    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  39.11 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  35.52 
 
 		 551 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  34.49 
 
 		 542 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 610 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  33.1 
 
 		 544 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 555 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  25.89 
 
 		 667 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 573 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 561 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 533 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 497 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 506 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  24.69 
 
 		 530 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.88 
 
 		 507 aa  94  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 478 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 494 aa  92  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 473 aa  91.3  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 514 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  41.78 
 
 		 548 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  23.01 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.69 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  26.14 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.31 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.17 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 562 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 505 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.68 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 521 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  21.39 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 519 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 530 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  22.32 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 499 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 624 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.46 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>