179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5675 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  73.92 
 
 		 610 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 608 aa  1263    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  49 
 
 		 633 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  42.18 
 
 		 583 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  36.04 
 
 		 667 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 560 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 544 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 542 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 499 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  24.96 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 479 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 548 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 561 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 555 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  24.19 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.06 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 540 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 480 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  35 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.57 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 591 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 664 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  38.75 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.9 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.02 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  39.36 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  27.68 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.39 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  37.62 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 613 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 604 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  37.36 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.69 
 
 		 499 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 603 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  40.96 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 479 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 493 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 562 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.61 
 
 		 467 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  34.95 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.88 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  28.32 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 564 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>