247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1016 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 594 aa  1215    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  38.8 
 
 		 544 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 542 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 610 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 533 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 633 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  25.73 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  26.82 
 
 		 667 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 604 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 547 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.41 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 499 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  36.48 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  40.6 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.61 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  37.78 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  35.41 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  21.48 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  24.79 
 
 		 502 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.08 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  38.17 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 469 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  33.61 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.9 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  23.55 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 492 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  23.02 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  34.85 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.21 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 582 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  35.48 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.62 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  30.19 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  35 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  34.78 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>